Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MIS18AQ9NYP9 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms