Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SS18Q15532 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms