Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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