Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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VAX2Q9UIW0 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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VAX2Q9UIW0 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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VAX2Q9UIW0 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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VAX2Q9UIW0 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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VAX2Q9UIW0 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAX2Q9UIW0 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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VAX2Q9UIW0 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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VAX2Q9UIW0 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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