Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHD3Q12873 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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