Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SSFA2P28290 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms