Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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