Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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