Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTPRAP18433 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTPRAP18433 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTPRAP18433 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTPRAP18433 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTPRAP18433 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTPRAP18433 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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PTPRAP18433 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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PTPRAP18433 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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