Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP35Q9P2H5 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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