Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms