Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SP140Q13342 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SP140Q13342 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SP140Q13342 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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SP140Q13342 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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SP140Q13342 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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SP140Q13342 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SP140Q13342 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SP140Q13342 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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