Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 LY6G6D-223ENST00000375825 402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 SNORD3J-201ENST00000408473 190 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC006455.4-201ENST00000418297 528 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ZEB2-AS1-201ENST00000421083 453 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 FAM41AY1-201ENST00000421205 906 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC005840.2-201ENST00000447193 355 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC073188.4-201ENST00000450077 528 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 FAM41AY2-201ENST00000458627 906 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RN7SL496P-201ENST00000470372 290 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 PAQR9-AS1-202ENST00000493825 576 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC079313.2-201ENST00000550474 564 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC009779.4-201ENST00000554248 611 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC091180.5-201ENST00000576461 382 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RN7SL154P-201ENST00000578043 324 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RN7SL785P-201ENST00000578437 253 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AP005210.1-201ENST00000583659 544 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC106800.1-201ENST00000501221 1362 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC012360.3-201ENST00000610036 3449 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AL356387.1-201ENST00000426321 476 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 OR7H1P-201ENST00000448965 922 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 PPIAP28-201ENST00000458378 485 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC007547.2-201ENST00000468802 360 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 LINC02121-201ENST00000507950 432 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms