Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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