Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms