Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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DDX39BQ13838 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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DDX39BQ13838 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
DDX39BQ13838 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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