Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms