Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm3550W4VSN7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms