Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vamp5Q9Z2P8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vamp5Q9Z2P8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms