Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn7Q9Z261 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn7Q9Z261 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms