Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ilf3Q9Z1X4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms