Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b1Q9Z1T1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms