Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf394Q9Z1D9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf394Q9Z1D9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf394Q9Z1D9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf394Q9Z1D9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf394Q9Z1D9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf394Q9Z1D9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf394Q9Z1D9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf394Q9Z1D9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf394Q9Z1D9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf394Q9Z1D9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf394Q9Z1D9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms