Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms