Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cldn9Q9Z0S7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cldn9Q9Z0S7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cldn9Q9Z0S7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cldn9Q9Z0S7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cldn9Q9Z0S7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms