Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx9Q9WUH2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms