Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra1Q9R118 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms