Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmed2Q9R0Q3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms