Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms