Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg1Q9QZE5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg1Q9QZE5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms