Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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