Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms