Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaja4Q9JMC3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja4Q9JMC3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms