Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms