Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc5a3Q9JKZ2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms