Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb3Q9JKS4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms