Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nova1Q9JKN6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms