Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra4Q9JJT2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms