Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms