Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl28Q9JIL2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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