Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EefsecQ9JHW4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EefsecQ9JHW4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms