Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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