Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cldn12Q9ET43 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn12Q9ET43 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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