Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn19Q9ET38 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms