Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Pgpep1Q9ESW8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Pgpep1Q9ESW8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Pgpep1Q9ESW8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pgpep1Q9ESW8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms