Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc4Q9ES56 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms