Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lima1Q9ERG0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms