Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfip11Q9ERA6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms