Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn2Q9ER65 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn2Q9ER65 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn2Q9ER65 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms