Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rapgef4Q9EQZ6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms